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Cod UNG(尿嘧啶DNA糖基化酶)
产品介绍
Cod Uracil-DNA Glycosylase
Cod UNG(尿嘧啶DNA糖基化酶)
描述
Cod UNG酶能够选择性水解双链或单链DNA中尿嘧啶与脱氧核糖之间的N-糖苷键,形成缺失一个碱基位点(无嘧啶)的DNA链,在碱性溶液及高温条件下会进一步水解断裂,从而被完全水解;且Cod UNG酶对RNA中的尿嘧啶无活性。该酶是PCR、RT-PCR及qPCR等分析方法中消除carry-over污染的理想选择。在分子诊断中,即使痕量的DNA污染也能显著降低检测灵敏度,因此,UNG酶在分子诊断领域应用非常广泛。
与其他来源UNG酶相比,Cod UNG酶具有低温活性、在温和热处理条件下(55℃)完全不可逆失活等优势,能够提高PCR反应的效率及灵敏度,并能提高PCR产物的长期稳定性,便于下游应用,如克隆构建、测序等。此外,在55℃条件下完全不可逆失活,Cod UNG能用于一步RT-qPCR中。
Cod UNG适用于常见的缓冲体系,兼容多种样本类型。Cod UNG的优异性能,使其易于使用、便于自动化操作、兼容绝大多数工作流程,如PCR、qPCR、RT-PCR等。
Cod UNG的开发及生产流程符合ISO13485质量体系认证。此外,为了满足欧盟REACH法规要求,ArcticZymes推出Triton X-100 free的产品(Cod UNG Triton FREE);同时,随着应用场景的拓展及行业更高要求的发展,ArcticZymes也推出了glycerol-free的可冻干剂型。
优势
1. 第一款热不稳定的UNG酶,反应更快、温度更低,室温孵育5分钟即可完成;
2. 第一款完全不可逆热灭活的UNG酶(55℃),改善下游应用实验结果;
3. 提高PCR/qPCR检测灵敏度;
4. 兼容多种样本类型,尤其适合PCR诊断应用。
推荐应用
1. 用于PCR及RT-PCR中消除carry-over污染;
2. 改善PCR产物的下游应用,如克隆构建、测序等;
3. 反应温度更低,更适于病毒检测;
4. 能用于一步RT-PCR反应。
使用指导
Cod UNG能够兼容市售所有master mix。务必确保:PCR体系中含有dUTP。PCR产物用于下游分析之前,保存在4℃或-20℃。
数据
1. 完全不可逆热灭活
目前市售有多种商业化的UNG酶,其中大多数是细菌来源。如果不涉及post-PCR的应用,大多数UNG酶都能满足使用要求。然而,如果需要将PCR产物用于下游分析,如克隆构建和测序,那么UNG酶的再激活(reactivation)及随之引起的PCR产物降解是大多数市售UNG酶的一个通用问题。ArcticZymes的Cod UNG酶是目前第一款完全、不可逆热灭活的UNG酶。
Figure 1. Cod UNG是唯一一款完全、不可逆热灭活的UNG酶。PCR反应体系包含10mM dATP、dCTP、dGTP和20mM dUTP及1U的UNG酶(Cod UNG及另外4种市售型号)。PCR反应后,室温孵育0hr、1hr、3hr、6hr及24hr,然后agarose-gel分析PCR产物降解情况。
Figure 2. 两种UNG处理的PCR产物的测序图谱。室温下,用1U的Cod UNG(A)和1U的E.coli UNG(B)处理PCR产物3hr,然后进行测序分析。由图可知,Cod UNG处理的PCR产物完整性更好、质量更高。
2. 提高qPCR灵敏度
在分子诊断的一些应用中,如病原检测,样品中目标分子含量有限,因此检测灵敏度成为非常关键的因素。Carry-over DNA污染严重降低qPCR的检测灵敏度。使用Cod UNG能够保持PCR产物的完整性,并能够去除污染物、恢复灵敏度及检测的动态范围。
Figure 3. 制备5个浓度的人血清稀释的RNA病毒样品,各样品中加入含尿嘧啶的扩增序列模拟carry-over DNA污染。使用标准一步法RT-qPCR对RNA定量检测。Carry-over DNA严重降低检测灵敏度(橙色),加入Cod UNG恢复灵敏度(绿色)到与对照组(黄色)一致。
3. 更适于病毒检测
病毒诊断检测的困难之一是病毒固有的基因组变异。Cod UNG酶活温度范围更宽,其中较低的酶活温度,更适于病毒诊断。降低引物退火的反应温度,引物结合区段错配容忍度增强,——这能检测更多的病毒亚型,减少诊断中假阴性的风险。Cod UNG在低温时的高活性,及50℃条件下不可逆失活,成为病毒诊断流程中RT-qPCR的理想组分。
Figure 4. 在人total RNA样品中,加入Cod UNG、E. coli UNG及另外两个品牌(A和B)的冷适应UNG,进行RT-qPCR检测。A和B品牌的UNG在50-60℃条件下不能完全失活,降解部分cDNA从而影响了检测灵敏度;E. coli UNG反应温度相对较高(最适温度为50℃左右),影响RNA反转录成cDNA效率,且不能完全失活进而降解部分cDNA。
4. 兼容多种样本类型
血液样本常用于直接PCR病原检测诊断。实践发现,血液样本的组分通常会抑制PCR中的酶活性,如UNG。Cod UNG能很好耐受全血及血浆中的组分,如血清和抗凝血剂等。由于它能兼容更广泛的生物样本类型,Cod UNG是直接PCR诊断的理想选择。
Figure 5. Cod UNG能够兼容多种血液样本组分。多种血液样本组分存在情况下,如血清、EDTA处理的血浆、Na-Heparin处理的血浆、EDTA处理的血液及Na-Heparin处理的血液,检测Cod UNG的活性。
酶学特征
来源:Arctic cod origin, E.coli重组表达
酶比活:>5.00 x 10^5 Units/mg
酶活定义:37℃条件下,一个单位的UNG酶是指1hr内从含尿嘧啶的DNA中释放1nmol尿嘧啶所需的酶量。
纯度:高纯级别,无其他核酸酶活性残留。
热灭活:50℃-55℃、20分钟,完全不可逆失活。
货号 |
描述 |
规格 |
浓度 |
储存条件 |
70500-201 |
Cod UNG, 100 U |
100 U |
1 U/µl |
-20 ℃ |
70500-202 |
Cod UNG, 1000 U |
1000 U |
1 U/µl |
-20 ℃ |
70501-201 |
Cod UNG Triton FREE, 100 U |
100 U |
1 U/µl |
-20 ℃ |
70501-202 |
Cod UNG Triton FREE, 1000 U |
1000 U |
1 U/µl |
-20 ℃ |
70510-105 |
Cod UNG Glycerol-free, 5000 U |
5000 U |
50 U/µl |
-20 ℃ |
70510-150 |
Cod UNG Glycerol-free, 50 kU |
50 kU |
50 U/µl |
-20 ℃ |
70511-105 |
Cod UNG Glycerol-free Triton FREE, 5000 U |
5000 U |
50 U/µl |
-20 ℃ |
70511-150 |
Cod UNG Glycerol-free Triton FREE, 50 kU |
50 kU |
50 U/µl |
-20 ℃ |
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